bioinformatics
本站收录 25 个带「bioinformatics」标签的 AI 开源项目
cs-video-courses这是一个精心整理的计算机科学视频课程清单，收录了全球顶尖大学和机构的免费视频讲座，涵盖算法、人工智能、系统、理论、生物信息学、计算物理等广泛领域。项目解决了计算★ 83,580
open-scienceOpen Science 是一个开源、本地优先、模型无关的 AI 科研工作台，专为科学发现而设计。它解决了科研人员在文献调研、数据分析和实验设计中信息过载、工具★ 5,293
openscienceOpenScience 是一个面向科学研究的开源 AI 工作台，旨在帮助科研人员更高效地开展文献调研、实验设计和论文写作。它通过集成多种大语言模型（LLM）和智★ 3,845
k-dense-byokk-dense-byok 是一个运行在桌面端的 AI 联合科学家，基于 Scientific Agent Skills 构建，旨在帮助科研人员加速药物发现和生物★ 1,283
wisp-sciencewisp-science 是一个开源的、本地优先的桌面 AI 研究工作台，专为科学计算场景设计。它解决了科研人员在数据分析、生物信息学等任务中需要频繁切换工具、★ 1,179
ClawBioClawBio 是一个生物信息学原生的 AI 智能体技能库，致力于为基因组学、群体遗传学等生物信息学场景提供可复现、本地优先的 AI 辅助分析能力。它解决的核心★ 1,149
KG_RAGKG_RAG 是一个基于知识图谱的检索增强生成（RAG）框架，旨在增强大语言模型在知识密集型任务上的表现。它通过将知识图谱的结构化知识与 LLM 的生成能力相结★ 947
ScienceClawScienceClaw 是一个面向科学家的自进化 AI 研究助手，基于 TypeScript 构建，集成了 285 项科研技能，覆盖文献综述、元分析、生物信息学★ 908
ScienceClawScienceClaw 是一个基于 LangChain DeepAgents 和 AIO Sandbox 基础设施构建的个人科研助手，采用全新架构，强调安全性、★ 668
mLLMCelltypemLLMCelltype 是一个利用多种大语言模型（LLM）进行单细胞 RNA 测序数据细胞类型注释的开源工具。它通过集成多个 LLM 的共识结果，解决传统注释★ 662
biomcpBioMCP 是一个用 Rust 实现的开源 MCP（模型上下文协议）服务器，面向生物医学与临床研究场景。它把分散在 PubMed、PubMed Central★ 644
PantheonOSPantheonOS 是一个面向数据科学场景的通用、可演化、分布式的智能体框架与运行环境。它旨在解决传统数据科学工作流中工具链割裂、流程难以自动化以及智能体协作★ 488
BioReasonBioReason 是一个面向生物领域的多模态大语言模型，核心创新在于将 DNA 序列与文本、图像等多模态信息融合，并引入推理激励机制，让模型在理解 DNA 序★ 406
SciAgent-SkillsSciAgent-Skills 是一个为 Claude Code 及其他 AI 智能体打造的生物信息学与生命科学技能库，包含 197 个可复用的技能模块，覆盖 ★ 367
helicalhelical 是一个专注于基因组学和转录组学模态的预训练生物基础模型框架，旨在为研究人员提供开箱即用的先进生物模型。它解决了生物信息学领域模型复用难、标准化缺★ 231
awesome-bio-agent-skills这是一个精选的生物医学研究AI智能体技能集合，旨在为研究人员提供可直接复用的智能体能力库。项目覆盖基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、临床AI和蛋白质设计等关键领★ 191
ScienceAgentBenchScienceAgentBench 是一个面向数据驱动科学发现的语言智能体评估基准，由加州大学等机构在 ICLR 2025 提出。它旨在解决当前科学智能体评估中★ 174
AgentFigureGalleryAgentFigureGallery 是一个为 Claude Code、Codex、Cursor 等 AI 编程助手设计的科学绘图技能包，旨在让这些智能体直接生★ 157
Awesome-LLMs-meet-genomesAwesome-LLMs-meet-genomes 是一个聚焦大语言模型（LLM）与基因组学交叉领域的开源资源合集，系统整理了基础理论、应用案例、相关论文与最佳★ 156
pansegpanseg 是一个面向密集堆积 3D 体积图像的细胞实例感知分割工具。它主要解决在生物图像分析中，细胞在三维空间内高度重叠、难以准确区分个体边界的问题。该工具★ 130
DrugClawDrugClaw 是一个面向药物研发的 AI 研究助手，用 Rust 编写，旨在加速药物发现流程。它解决的是科研人员在浩如烟海的文献、专利和实验数据中手动检索、★ 125
DeepSpotDeepSpot 是一个基于深度学习的开源模型，用于从 H&E 组织病理学图像预测空间转录组。它支持 Visium 的 spot 级别和 Xenium 的单细胞★ 101
clinicaltrialsgov-mcp-server这是一个基于 MCP（模型上下文协议）的临床研究数据服务，专为 AI 智能体设计。它解决了 AI 应用难以直接访问权威临床试验数据的问题，通过标准化的 MCP ★ 96
pygtftkpygtftk 是一个用于处理 GTF 文件的 Python 包和命令行工具集。GTF 是基因组注释的通用格式，包含基因、转录本、外显子、CDS 等特征信息。该★ 52
ChatCellChatCell是一个面向单细胞数据分析的开源模型，旨在让研究人员通过自然语言与单细胞数据交互，无需编写复杂代码。它解决了单细胞分析中编程门槛高、流程繁琐的问题★ 52