spmind

让 AI 智能体自动跑完空间蛋白组分析全流程

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 行业应用 🍴 复刻 23 👀 关注 9
GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 280
维护状态 较活跃
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源学术项目,定价信息待确认

项目预览

spmind 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类行业应用
开发团队tomtommyyuan
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源学术项目,定价信息待确认
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
开源协议Apache-2.0
主要语言Python
技术栈/模型ai-agents,ai4science,benchmark,bioinformatics,biomedical-ai,icml-2026,spatial-biology,spatial-proteomics
GitHub 星标★ 280
上线时间2026-05-11 00:00:00
代码更新2026-10-04
仓库体积7.1 MB
本站数据更新2026-10-24
维护状态较活跃
收录时间2026-10-24
浏览次数0

项目介绍

spmind 是面向空间蛋白质组学的自主 AI 智能体,目标是让多路成像实验从原始图像到生物学结论的整条分析链路尽可能自动化。空间蛋白质组学实验通常包含图像预处理、细胞分割、标记表达量化、细胞表型聚类、空间邻域与组织架构分析等多步操作,步骤繁琐且高度依赖专家经验。spmind 用智能体调度分析工具与代码执行,根据任务目标自主规划步骤、调用方法并产出结果,降低非计算背景研究者的使用门槛。项目同时提出 SP-Bench,用于评测智能体在多路成像工作流中的规划与执行能力,为 agentic 科研工具提供可比较的基准。代码为 Python 实现,属于 AI for Science 方向的早期开源项目。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-10-24 · 当前星标 ★ 280

核心亮点

  • 把图像预处理、分割、量化、聚类、空间分析串成端到端智能体流程,减少手工拼接脚本
  • 自带 SP-Bench 基准,可量化评估智能体在多路成像任务上的规划与执行表现
  • 面向 AI for Science 场景设计,贴合空间生物学真实分析步骤而非通用问答演示

不足之处

  • 早期项目,星标与社区规模较小,实际使用案例和第三方验证有限
  • 依赖具体成像平台与数据格式,跨实验室数据适配成本待观察

适用场景

  • 空间蛋白质组学多路成像数据的自动化预处理与细胞分割
  • 研究者用自然语言描述分析目标,由智能体规划并执行下游统计流程
  • 作为 agentic 科研工作流的评测基线,对比不同智能体方案

替代项目

Squidpy、scimap、CellProfiler

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