mLLMCelltype 是行业应用领域的开源项目，由 cafferychen777 开发，2025 年首次发布。
它收录于行业应用分类，该分类目前共有 545 个项目，GitHub 星标数为 662。
项目保持着较活跃的维护节奏，最近一次代码更新于 2026-09-22。MIT许可证，完全免费，可自行部署使用。
它主要面向的使用场景是：单细胞转录组数据细胞类型标注。同类可对比的替代方案包括 CellTypist、scArches、ItClust。
mLLMCelltype
多模型投票，单细胞注释又快又准
mLLMCelltype 是一个利用多种大语言模型（LLM）进行单细胞 RNA 测序数据细胞类型注释的开源工具。它通过集成多个 LLM 的共识结果，解决传统注释方法依赖标记基因库、泛化能力差和人工成本高的问题。核心能力包括：自动从单细胞数据中提取特征基因，调用多个 LLM 进行独立注释，并通过投票或加权机制综合出最终细胞类型标签。该工具支持主流 LLM 接口（如 GPT、Claude 等），提供 Python API 和命令行界面，可无缝嵌入现有单细胞分析流程（如 Scanpy）。其优势在于无需训练即可适配新组织或新物种，显著提升注释的准确性和可解释性。
开源
free
开源模型
GitHub 星标
★ 662
维护状态
较活跃
是否开源
是
定价模式
free
项目数据
分类开源模型
开发团队cafferychen777
所属国家
定价模式free
价格说明开源项目，MIT许可证，完全免费，可自行部署使用。
访问状态
是否开源是
开源协议MIT
主要语言Python
技术栈/模型bioinformatics,cell-type-annotation,computational-biology,consensus-algorithm,large-language-models,llm,scanpy,scrna,scrnaseq-analysis,seurat,single-cell
GitHub 星标★ 662
30天Star增速
HF 下载量
上线时间2025-04-07 00:00:00
最近更新2026-09-22 00:00:00
维护状态较活跃
中文支持
访问方式
移动端支持
综合评分
收录时间2026-08-09
浏览次数2
使用教程
核心亮点
- 集成多LLM共识，降低单一模型偏差，注释更可靠
- 无需训练，开箱即用，适配新数据集的泛化能力强
- 提供Python API和CLI，易于集成到Scanpy等现有流程
不足之处
- 依赖外部LLM API，需联网且产生费用
- 文档/社区待观察
适用场景
- 单细胞转录组数据细胞类型标注
- 跨物种或新组织类型的注释（缺乏参考标记库时）
- 自动化单细胞分析流程中的快速初步注释
替代项目
CellTypist、scArches、ItClust
项目介绍
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