项目预览
项目数据
项目介绍
Star 增长趋势
本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整
数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-11-03 · 当前星标 ★ 1692
使用教程
⚠ 本教程由 AI 依据该项目 README 整理;原始文档不完整,部分步骤为通用流程推断,实际安装请以项目官方文档为准。
⚠ 该项目 README 未提供完整安装说明,以下步骤为通用流程,请以官方文档为准。
环境要求
- Python 环境(README 未注明具体版本,以 PyPI 页面要求为准)
- PyTorch(PyHealth 是基于 PyTorch 的工具箱)
- 可访问 PyPI 以安装 pyhealth 包
- 使用 MIMIC-III/IV、eICU、OMOP 等临床数据时需自行取得对应数据集的授权访问
安装与启动步骤
-
1确认 Python 环境
先确认本机已装 Python 与 pip,可正常执行命令;README 未给出最低版本要求。
python --version pip --version -
2安装 PyHealth
README 的 PyPI 徽章指向 pyhealth 包,可直接用 pip 从 PyPI 安装。
pip install pyhealth -
3验证导入
在 Python 中导入包,无报错即说明安装成功。
python -c "import pyhealth" -
4按官方教程跑通流程
README 指向 ReadTheDocs 教程与 Colab 示例,按其数据加载、建模、评测顺序体验。
如何确认成功
执行 python -c "import pyhealth" 无报错,即表示库已正确安装并可导入。
常见问题
Q:安装后导入报错怎么办?
A:先确认 pip 与 python 属于同一个解释器(可用 python -m pip install pyhealth 重装),再检查 PyTorch 是否已正确安装。
Q:需要自己准备临床数据吗?
A:需要。MIMIC、eICU、OMOP 等数据集各有独立申请与授权流程,README 未提供下载命令,请按数据集官方渠道获取。
Q:支持哪些数据类型?
A:README 说明支持电子病历(MIMIC-III、MIMIC-IV、eICU、OMOP)、临床文本、生理信号(EEG、ECG)和医学影像。
Q:有没有现成的上手示例?
A:README 提供了 ReadTheDocs 教程页与 Google Colab 教程入口,可从官网 pyhealth.dev 或文档站进入。
注意事项
- README 节选未包含安装章节,安装命令依据 PyPI 徽章推断,请以官方文档为准。
- 临床数据涉及隐私与授权,请勿使用未获授权或含个人身份信息的数据。
- 训练深度模型建议在具备 GPU 的环境中运行,README 未给出显存要求。
核心亮点
- 内置 MIMIC、eICU、OMOP 等主流 EHR 数据集的加载与预处理,省去大量清洗工作
- 提供 30 多个模型实现和标准化训练评测流程,便于横向基准对比
- 覆盖 EHR、临床文本、信号、影像多模态数据,一个工具链贯通多种任务
不足之处
- 医疗数据集需自行申请授权,上手门槛和合规成本较高
- 部分模型与数据集适配仍在演进,文档和示例覆盖不均衡
适用场景
- 基于 MIMIC 做住院患者再入院或死亡率预测实验
- 临床文本与结构化 EHR 联合建模的研究原型验证
- 医疗 AI 课程或实验室中搭建可复现的基准实验环境
替代项目
MONAI、PyTorch Geometric、scikit-learn
上一篇:Nola-Translator
同类项目推荐
LangCoop
开源
让自动驾驶车辆用自然语言沟通,实现协同驾驶。
Official implementation of LangCoop: Collaborative Driving with Natural Language
RFD4-Proteina
开源
按条件约束生成蛋白质骨架,省去手工设计
Generative biopolymer design with rich conditioning.
chroma
开源
按约束条件直接生成全新蛋白质结构
A generative model for programmable protein design
mavsdk_drone_show
开源
用 Python 轻松调度无人机集群,从仿真到表演一站式搞定。
Open-source MAVLink fleet operations for PX4: SITL, drone shows, search and rescue, ···
Biomni
开源
一句话调度生物医学工具,自动跑完多步分析
Biomni: a general-purpose biomedical AI agent
zhilv-yuntu
开源
说句话就生成可落地的中文旅行行程
An AI travel planning system built with FastAPI, LangChain, ChromaDB, and AMap servi···
ReSim
开源
用扩散模型生成逼真驾驶视频,低成本测试自动驾驶系统
[NeurIPS 2025 Spotlight] ReSim: Reliable World Simulation for Autonomous Driving
MyRecipeBook
开源
用 ChatGPT 管食谱,DDD 架构轻松部署 Azure
API REST de gerenciamento de receitas em .NET com DDD e Clean Architecture. Autentic···
Motus
开源
一个模型同时生成视频和控制机器人,让机器人从视频中学习世界规律。
Official code of Motus: A Unified Latent Action World Model
