RFD4-Proteina

按条件约束生成蛋白质骨架,省去手工设计

开源 🏷️定价信息待确认 ⏳ 访问状态待核验 行业应用 🍴 复刻 65 🐛 待处理 23 👀 关注 3
访问官网 ↗ GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 531
维护状态 活跃
是否开源 开源
定价模式 🏷️定价信息待确认

项目预览

RFD4-Proteina 项目界面预览图
图片来源:项目官网

项目数据

分类行业应用
开发团队RosettaCommons
定价模式🏷️定价信息待确认
价格说明定价信息待确认
访问状态⏳ 访问状态待核验
是否开源是
开源协议BSD-3-Clause
主要语言Python
GitHub 星标★ 531
上线时间2026-09-25 00:00:00
代码更新2026-11-02
仓库体积93.0 MB
本站数据更新2026-11-03
维护状态活跃
收录时间2026-11-03
浏览次数0

项目介绍

RFD4-Proteina 是一个面向生物聚合物生成式设计的开源项目,核心目标是在丰富条件约束下生成蛋白质等生物大分子结构。它把扩散式生成模型与多类条件信号结合,让研究者可以按序列、结构 motif、对称性、配体结合位点等约束来采样候选骨架,而不必从零手工设计。项目以 Python 实现,提供训练与推理脚本、配置体系和示例流程,便于在自有数据上微调或直接做条件生成实验。它解决的是传统蛋白质设计流程中条件控制弱、采样效率低、实验前筛选成本高的问题,适合做 binder 设计、酶骨架探索和对称组装体构思等任务。整体定位偏研究原型,代码结构清晰,但生态和文档仍在完善中,适合有一定深度学习与结构生物学背景的团队二次开发。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-11-03 · 当前星标 ★ 531

核心亮点

  • 支持序列、motif、对称性、结合位点等多种条件联合约束,生成可控性较强
  • 提供完整训练与推理脚本及配置体系,便于在自有数据上复现和微调
  • 基于扩散生成范式,采样多样性好,适合探索性设计任务

不足之处

  • 项目处于早期阶段,文档和教程覆盖有限,上手需要较多领域背景
  • 缺少大规模基准评测与湿实验验证数据,效果稳定性待观察

适用场景

  • 蛋白质结合剂(binder)候选骨架的条件生成
  • 含特定功能 motif 的酶或支架蛋白设计探索
  • 对称组装体与多聚体结构的生成式构思

替代项目

RFdiffusion、ProteinMPNN、OpenFold

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