instanseg

显微图像一键分割细胞核,省去手工标注

开源 free 计算机视觉
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GitHub 星标 ★ 247
维护状态 较活跃
是否开源 是
定价模式 free

项目预览

项目数据

分类计算机视觉
开发团队instanseg
所属国家
定价模式free
价格说明开源免费,基于PyTorch,需自行部署
访问状态
是否开源是
开源协议Apache-2.0
主要语言Python
技术栈/模型
GitHub 星标★ 247
30天Star增速
HF 下载量
上线时间2024-08-22 00:00:00
代码更新—
仓库体积—
本站数据更新—
维护状态较活跃
中文支持
访问方式
移动端支持
综合评分
收录时间2026-10-15
浏览次数0

项目介绍

InstanSeg 是一个基于 PyTorch 的细胞与细胞核分割工具,专门处理荧光和明场显微镜图像。它解决的是生物医学图像分析中一个高频痛点:如何从显微图像里自动、准确地分离出每个细胞或细胞核,替代传统阈值分割或手工标注。核心能力包括:支持荧光和明场两种成像模式,能同时完成细胞和细胞核的分割任务;基于 PyTorch 实现,便于训练、微调和集成到现有深度学习流程;提供从图像输入到分割掩码输出的完整管线,降低使用门槛。项目定位偏向科研场景,适合需要批量处理显微图像、做细胞计数或形态学分析的研究人员。目前星标 247,属于早期但方向明确的项目。

Star 增长趋势

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技术标签

使用教程

—

核心亮点

  • 同时支持荧光和明场两种显微成像模式,覆盖常见实验场景
  • 基于 PyTorch,方便在现有深度学习流程中训练和微调
  • 提供细胞与细胞核分割的完整管线,开箱即用

不足之处

  • 项目早期,预训练模型和文档完善度有待观察
  • 社区规模较小,遇到问题可参考的案例和讨论有限

适用场景

  • 生物医学研究中批量细胞计数与形态学分析
  • 荧光显微图像中细胞核的自动分割与定位
  • 明场显微图像下的细胞分割预处理

替代项目

Cellpose、StarDist

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