DNA-Diffusion

用扩散模型生成定制调控DNA序列，加速基因研究

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GitHub 星标 ★ 491

维护状态较活跃

是否开源开源

定价模式 🏷️完全免费开源项目，提供在线文档和演示，代码免费使用，无付费版本。

项目预览

DNA-Diffusion 项目界面预览图 — 图片来源：GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类图像生成

开发团队pinellolab

官网地址https://pinellolab.github.io/DNA-Diffusion

GitHubhttps://github.com/pinellolab/DNA-Diffusion

定价模式🏷️完全免费

价格说明开源项目，提供在线文档和演示，代码免费使用，无付费版本。

访问状态✅ 目前可打开

是否开源是

开源协议NOASSERTION

主要语言Python

技术栈/模型deep-learning,diffusion-models,diffusion-probabilistic-models,generative-model,genomics,regulatory-genomics,stable-diffusion

GitHub 星标★ 491

上线时间2022-09-15 00:00:00

代码更新2026-10-28

仓库体积117.7 MB

本站数据更新2026-11-09

维护状态较活跃

收录时间2026-08-09

浏览次数3

项目介绍

DNA-Diffusion 是一个将扩散概率模型应用于调控基因组学的开源项目，旨在生成具有特定调控特征的 DNA 序列。它解决了传统方法难以建模 DNA 序列复杂调控逻辑的问题，通过训练扩散模型学习调控序列的分布，从而生成符合特定转录因子结合或染色质状态的新序列。核心能力包括：基于稳定扩散框架的 DNA 序列生成、条件生成（如指定细胞类型或调控因子）、以及序列功能预测。项目提供完整的训练和采样流程，支持自定义调控特征，为合成生物学和基因调控研究提供新工具。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化，观测越久曲线越完整

数据来源：GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-08-09 · 当前星标 ★ 491

技术标签

deep-learning diffusion-models generative-model genomics stable-diffusion

使用教程

难度：高级约 60 分钟部署方式：本地GPU 5 步

环境要求

CUDA 显卡
Python 3.10+
模型权重

安装与启动步骤

1装包

它有发布包，可直接装。
```
pip install dnadiffusion
```
2拉仓库看示例

文档与示例都在仓库里。
```
git clone https://github.com/pinellolab/DNA-Diffusion.git
```
3取预训练权重

权重在模型站上，按说明取。
4跑生成

先按默认条件出一批序列。
5按细胞类型调条件

条件控制是它的核心能力。