OlinkRPackage 是行业应用领域的开源项目，由 Olink-Proteomics 开发，2019 年首次发布。
它收录于行业应用分类，该分类目前共有 552 个项目，GitHub 星标数为 139。
项目保持着较活跃的维护节奏，最近一次代码更新于 2026-09-23。开源R包，免费使用。
它主要面向的使用场景是：临床队列血浆样本的Olink蛋白组差异表达分析。同类可对比的替代方案包括 DEP、limma。
OlinkRPackage
Olink蛋白组数据一键读入R并完成质控与差异分析
OlinkRPackage 是 Olink 公司官方维护的 R 语言工具包，专门用于处理和分析 Olink 平台产生的蛋白质组学数据。Olink 技术基于 PEA（邻近延伸分析）检测血浆等样本中的数百至数千种蛋白，数据以 NPX（相对定量）形式输出。该包解决的核心问题是：把原始 Olink 检测结果标准化地读入 R，并完成质量控制、归一化、差异表达、通路富集等下游分析。核心能力包括读取 NPX 与 Ct 数据、计算检出限、样本与蛋白层面的质控、桥接归一化、随机效应与批次校正、差异丰度分析、火山图与热图可视化，以及与 limma、stats 等 R 生态的衔接。它让不具备生信背景的实验人员也能用统一函数完成从数据导入到生物学解释的流程，减少手工整理和重复造轮子。
开源
free
行业应用
GitHub 星标
★ 139
维护状态
较活跃
是否开源
是
定价模式
free
项目数据
分类行业应用
开发团队Olink-Proteomics
所属国家
定价模式free
价格说明开源R包，免费使用
访问状态
是否开源是
开源协议AGPL-3.0
主要语言R
技术栈/模型olink,proteomics,proteomics-data-analysis,r,rstats
GitHub 星标★ 139
30天Star增速
HF 下载量
上线时间2019-11-06 00:00:00
最近更新2026-09-23 00:00:00
维护状态较活跃
中文支持
访问方式
移动端支持
综合评分
收录时间2026-09-29
浏览次数0
使用教程
核心亮点
- 官方维护，与Olink平台数据格式和NPX指标严格对齐，读入与质控函数开箱即用
- 覆盖从数据导入、归一化、差异分析到可视化的完整链路，减少自定义脚本
- 基于R/Bioconductor生态，可与limma等成熟统计工具直接衔接
不足之处
- 仅面向Olink平台数据，无法直接处理质谱或其他蛋白组学来源
- 功能深度依赖Olink官方推荐流程，非标准或自定义分析需自行扩展
适用场景
- 临床队列血浆样本的Olink蛋白组差异表达分析
- 多批次Olink数据的桥接归一化与批次效应校正
- 蛋白组数据的质控报告与火山图、热图可视化
替代项目
DEP、limma
项目介绍
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