OlinkRPackage

Olink蛋白组数据一键读入R并完成质控与差异分析

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 行业应用 🍴 复刻 38 🐛 待处理 6 👀 关注 8
GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 144
维护状态 活跃
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源R包,免费使用

项目预览

OlinkRPackage 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类行业应用
开发团队Olink-Proteomics
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源R包,免费使用
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
开源协议AGPL-3.0
主要语言R
技术栈/模型olink,proteomics,proteomics-data-analysis,r,rstats
GitHub 星标★ 144
上线时间2019-11-06 00:00:00
代码更新2026-11-10
仓库体积280.3 MB
本站数据更新2026-11-13
维护状态活跃
收录时间2026-09-29
浏览次数1

项目介绍

OlinkRPackage 是 Olink 公司官方维护的 R 语言工具包,专门用于处理和分析 Olink 平台产生的蛋白质组学数据。Olink 技术基于 PEA(邻近延伸分析)检测血浆等样本中的数百至数千种蛋白,数据以 NPX(相对定量)形式输出。该包解决的核心问题是:把原始 Olink 检测结果标准化地读入 R,并完成质量控制、归一化、差异表达、通路富集等下游分析。核心能力包括读取 NPX 与 Ct 数据、计算检出限、样本与蛋白层面的质控、桥接归一化、随机效应与批次校正、差异丰度分析、火山图与热图可视化,以及与 limma、stats 等 R 生态的衔接。它让不具备生信背景的实验人员也能用统一函数完成从数据导入到生物学解释的流程,减少手工整理和重复造轮子。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-09-29 · 当前星标 ★ 144

核心亮点

  • 官方维护,与Olink平台数据格式和NPX指标严格对齐,读入与质控函数开箱即用
  • 覆盖从数据导入、归一化、差异分析到可视化的完整链路,减少自定义脚本
  • 基于R/Bioconductor生态,可与limma等成熟统计工具直接衔接

不足之处

  • 仅面向Olink平台数据,无法直接处理质谱或其他蛋白组学来源
  • 功能深度依赖Olink官方推荐流程,非标准或自定义分析需自行扩展

适用场景

  • 临床队列血浆样本的Olink蛋白组差异表达分析
  • 多批次Olink数据的桥接归一化与批次效应校正
  • 蛋白组数据的质控报告与火山图、热图可视化

替代项目

DEP、limma

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