SuPreM

用海量CT数据预训练,让医学影像分析模型更准

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 开源模型 🍴 复刻 26 🐛 待处理 14 👀 关注 4
访问官网 ↗ GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 435
维护状态 较活跃
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源模型,MIT许可证,可自由使用,无付费版本。

项目预览

SuPreM 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类开源模型
开发团队MrGiovanni
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源模型,MIT许可证,可自由使用,无付费版本。
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
开源协议NOASSERTION
主要语言Python
技术栈/模型3d-segmentation,abdomen,ct,dataset,foundation-models,foundational-datasets,medical-imaging,monai,nnunet,organ-segmentation,pre-trained-model,representation-learning,segmentation,supervised-learning,transfer-learning
GitHub 星标★ 435
上线时间2023-11-26 00:00:00
代码更新2026-10-26
仓库体积39.6 MB
本站数据更新2026-11-07
维护状态较活跃
收录时间2026-08-09
浏览次数3

项目介绍

SuPreM 是一个面向医学影像分析的3D预训练模型库,基于ICLR 2024 oral论文提出。它利用9,262个CT体数据和25个标注类别进行监督预训练,解决了医学影像标注数据稀缺、通用预训练模型在医学任务上效果不佳的问题。核心能力包括提供多种预训练骨干网络(如ResNet、ViT等),支持2D和3D医学影像的迁移学习,并附带完整的预训练权重和微调代码。其创新点在于使用大规模CT数据上的监督信号(如器官分割标签)进行预训练,使模型能学到更丰富的解剖结构特征,从而在下游任务(如器官分割、病灶检测)中取得更优性能。项目代码结构清晰,易于集成到现有医学影像分析流程中。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-08-09 · 当前星标 ★ 435

使用教程

ℹ 本教程由 AI 依据该项目 README 整理,个别步骤可能需要按你的环境微调。

难度:高级 约 55 分钟 部署方式:本地GPU 4 步

环境要求

  • NVIDIA GPU(显存 16GB 起)
  • 医学影像数据集

安装与启动步骤

  1. 1拉仓库装依赖

    医学影像的 3D 预训练模型套件。

  2. 2下预训练权重

    仓库不含权重,按说明获取。

  3. 3在公开数据集上评测

    先用标准数据集复现报告指标。

  4. 4迁移到自己的数据

    换器官或模态要少量微调。

如何确认成功

在公开的腹部器官分割数据集上,Dice 指标与论文报告值接近,换到自己的数据后仍需微调才能用

注意事项

  • 它是 3D 医学影像的预训练模型,做分割而不是诊断。
  • 医学数据涉及隐私与伦理审批,获取与使用都有门槛。
  • 跨中心数据的分布差异大,直接套用精度会掉。
  • 结果不能用于临床决策,仅供研究。

核心亮点

  • 基于9,262个CT体数据和25个标注类别的监督预训练,特征表达更贴合医学影像
  • 提供多种预训练骨干网络(ResNet、ViT等),支持2D/3D迁移学习,适配性强
  • ICLR 2024 oral论文背书,方法经过严格同行评审,性能有保障

不足之处

  • 仅支持CT模态,对MRI、X光等其他医学影像模态的泛化能力未知
  • 预训练数据规模相对有限(9k+),相比自然图像预训练(如ImageNet)仍有差距
  • 文档/社区待观察

适用场景

  • 医学影像中的器官分割任务(如肝脏、肾脏等)
  • 病灶检测与分类(如肺结节、肿瘤)
  • 医学影像领域的迁移学习研究,作为预训练权重初始化

替代项目

MONAI、nnU-Net、MedicalNet

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