get_model

模块化建模跨细胞类型转录调控,多模态数据一键训练

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 开源模型 🍴 复刻 32 🐛 待处理 20 👀 关注 3
GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 114
维护状态 低维护
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源框架,本地部署,完全免费

项目预览

get_model 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类开源模型
开发团队GET-Foundation
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源框架,本地部署,完全免费
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
主要语言Jupyter Notebook
技术栈/模型deep-learning,foundation-models,framework,pytorch
GitHub 星标★ 114
上线时间2024-08-21 00:00:00
代码更新2026-04-07
仓库体积265.5 MB
本站数据更新2026-11-10
维护状态低维护
收录时间2026-08-09
浏览次数3

项目介绍

get_model 是一个模块化的多模态跨细胞类型转录调控模型框架。它旨在解决不同细胞类型中基因表达调控机制差异性的建模问题,通过整合多种数据类型(如染色质可及性、转录因子结合等),构建能够跨细胞类型泛化的调控模型。其核心能力包括灵活的模块化设计,允许用户自定义特征提取和模型组合;支持多模态数据输入,捕捉转录调控的复杂性;并提供端到端的训练与评估流程。该项目处于早期阶段,基于 Jupyter Notebook 开发,便于研究探索和快速原型验证。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-08-09 · 当前星标 ★ 114

核心亮点

  • 模块化架构清晰,便于替换和组合不同特征与模型
  • 支持多模态数据整合,更全面刻画调控机制
  • 提供端到端流程,降低使用门槛

不足之处

  • 文档/社区待观察
  • 项目处于早期,功能完整性和稳定性未知

适用场景

  • 研究不同细胞类型特异的转录调控差异
  • 整合表观基因组和转录组数据预测基因表达
  • 构建可泛化的调控模型用于疾病机制探索

替代项目

scGen、CellOracle、scVI

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