SaprotHub

让生物学家轻松微调蛋白质语言模型,无需精通编程

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 开源模型 🍴 复刻 21 🐛 待处理 2 👀 关注 5
GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 171
维护状态 活跃
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源项目,MIT许可证,可免费使用和部署。

项目预览

SaprotHub 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类开源模型
开发团队westlake-repl
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源项目,MIT许可证,可免费使用和部署。
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
开源协议MIT
主要语言Jupyter Notebook
技术栈/模型colab-esm1b,colab-protein-language-model,colabesm,colabplm,colabprotbert,fine-tuning-protein-language-model,foundation-models,multimodal-protein,protein-fitness,protein-function-prediction,protein-language-model,protein-language-model-finetuning
GitHub 星标★ 171
上线时间2024-05-02 00:00:00
代码更新2026-11-05
仓库体积95.0 MB
本站数据更新2026-11-08
维护状态活跃
收录时间2026-08-09
浏览次数3

项目介绍

SaprotHub 是一个面向生物学家的蛋白质语言建模开源平台,旨在降低蛋白质AI模型的使用门槛。它解决了生物学家在应用蛋白质语言模型时面临的编程和计算资源障碍,提供了一套从模型微调到推理部署的完整工作流。核心能力包括:基于SaProt模型(结构感知蛋白质语言模型)的微调工具、支持多种下游任务(如稳定性预测、功能注释)、提供交互式Jupyter Notebook教程、以及模型共享与版本管理功能。通过标准化流程和友好接口,生物学家无需深入深度学习知识即可训练和应用定制化蛋白质模型,加速蛋白质工程与设计研究。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-08-09 · 当前星标 ★ 171

技术标签

核心亮点

  • 基于结构感知的SaProt模型,准确率优于纯序列模型
  • 提供Jupyter Notebook交互教程,上手门槛低
  • 支持多种蛋白质任务微调,覆盖稳定性、功能等预测

不足之处

  • 早期项目,文档和社区支持尚待完善
  • 依赖SaProt模型,计算资源需求较高

适用场景

  • 蛋白质稳定性预测与工程改造
  • 酶功能注释与活性优化
  • 生物信息学教学与科研快速验证

替代项目

ProtTrans、ESM (Evolutionary Scale Modeling)、ProteinMPNN

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