ceLLama

本地大模型跑单细胞注释,隐私快人一步,报告详尽。

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 开源模型 🍴 复刻 7 🐛 待处理 1 👀 关注 3
访问官网 ↗ GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 151
维护状态 低维护
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源项目,本地部署,完全免费

项目预览

ceLLama 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类开源模型
开发团队CelVoxes
官网地址https://celvox.co
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源项目,本地部署,完全免费
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
主要语言R
技术栈/模型celltype,large-language-models,llm,rna-seq,scanpy,seurat,single-cell
GitHub 星标★ 151
上线时间2024-06-16 00:00:00
代码更新2024-10-25
仓库体积86.9 MB
本站数据更新2026-11-07
维护状态低维护
收录时间2026-08-09
浏览次数5

项目介绍

ceLLama 是一个基于本地大型语言模型(LLMs)的细胞类型注释工具,专为单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析设计。它解决了传统细胞注释依赖云端API带来的隐私泄露风险和网络延迟问题,通过本地运行模型,确保数据隐私和响应速度。ceLLama 能够自动识别细胞类型,并生成详细定制的注释报告,帮助生物信息学家和研究人员快速理解细胞亚群。其核心能力包括:利用LLM的语义理解能力对标记基因进行深度解读,支持自定义提示词和模型参数调整,以及输出结构化的注释结果。该项目使用R语言编写,易于集成到现有的Bioconductor工作流中。目前处于早期阶段,但为单细胞数据分析提供了新的隐私保护方案。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-08-09 · 当前星标 ★ 151

技术标签

核心亮点

  • 本地推理保障数据隐私,无需上传敏感基因数据到云端
  • 利用LLM语义理解,注释结果比传统marker匹配更灵活
  • 生成定制化报告,包含注释依据和详细解释,便于审阅

不足之处

  • 依赖本地算力,对硬件配置有一定要求,可能不适合超大数据集
  • 早期项目,文档和社区支持尚不完善,需自行调试

适用场景

  • 生物信息学实验室处理单细胞测序数据,需快速且私密的细胞注释
  • 临床研究机构分析患者样本,避免基因数据外泄
  • 教学场景中,用于演示LLM在生物信息学中的应用

替代项目

SingleR、scCATCH、CellTypist

上一篇:XrayGLM

下一篇:PokeLLMon

同类项目推荐

ai-marketing-skills 开源

把营销和销售流程变成可调用的 AI 技能,开箱即用

Open-source AI marketing skills — growth experiments, sales pipeline, content ops, ···

★ 3790 2026-10-17
HackGpt 开源

AI 自动跑渗透测试,省人力出报告

Production-ready AI-powered pentesting & cybersecurity assistant with Agent, Chat & ···

★ 1303 2026-10-08
PyHealth 开源

统一临床数据与模型,快速跑通医疗 AI 实验

A deep learning toolkit for healthcare AI: EHR (MIMIC, eICU, OMOP), clinical text, s···

★ 1695 2026-11-03
3.0-Financial-Ai-Systems 开源

用机器学习与网络分析预测金融风险,优化投资组合

Machine learning and optimization models designed to enhance financial system stabil···

★ 284 2026-10-08
AI_SOC 开源

让 LLM 多智能体自动研判 Wazuh 告警,减少 SOC 人工翻日志

Open-source AI-augmented Security Operations Center using LLMs + Multi-Agent Orchest···

★ 175 2026-10-02
Medical_Image_Analysis 开源

用基础模型快速搞定医学图像分析,少标注也能高精度

Foundation models based medical image analysis

★ 243 2026-08-09
prism-insight 开源

多智能体协作,把行情新闻变成可执行买卖信号

AI-based stock analysis and trading system

★ 794 2026-09-16
JustHireMe 开源

本地AI求职助手,自动抓职位、评匹配、生成申请材料

Local-first AI job intelligence workbench for scraping roles, ranking fit, and gener···

★ 2272 2026-08-09