awesome-foundation-model-single-cell-papers

一张清单,快速掌握单细胞基础模型前沿动态

开源 🏷️完全免费 🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署 开源模型 🍴 复刻 67 👀 关注 20
访问官网 ↗ GitHub ↗
GitHub 星标 ★ 600
维护状态 较活跃
是否开源 开源
定价模式 🏷️完全免费 开源项目,MIT许可证,完全免费,无付费版本。

项目预览

awesome-foundation-model-single-cell-papers 项目界面预览图
图片来源:GitHub 官方仓库名片

项目数据

分类开源模型
开发团队OmicsML
定价模式🏷️完全免费
价格说明开源项目,MIT许可证,完全免费,无付费版本。
访问状态🔧 仅开源项目,无在线服务,需自行部署
是否开源是
开源协议MIT
技术栈/模型ai-virtual-cell,awesome-list,biological-foundation-model,large-language-models,single-cell-foundation-model,single-cell-multiomics,survey
GitHub 星标★ 600
上线时间2023-06-19 00:00:00
代码更新2026-10-26
仓库体积2.4 MB
本站数据更新2026-11-09
维护状态较活跃
收录时间2026-08-09
浏览次数5

项目介绍

这是一个精选论文列表,汇集了单细胞生物学领域的基础模型研究。它解决了单细胞数据高维、稀疏、异质性强,传统分析方法难以捕捉复杂细胞状态的问题。项目系统梳理了scGPT、Geneformer、scFoundation等前沿模型,按模型架构、预训练任务、下游应用等维度分类,并附有论文链接、代码仓库和简要说明,帮助研究者快速了解领域进展、对比模型优劣、找到适合自己数据的工具。

Star 增长趋势

本站每日记录该项目 GitHub 星标变化,观测越久曲线越完整

数据来源:GitHub API 逐日快照 · 收录于 2026-08-09 · 当前星标 ★ 600

使用教程

难度:入门 约 10 分钟 部署方式:无需环境 4 步

环境要求

  • 无需环境

安装与启动步骤

  1. 1先读配套综述

    清单结构跟着综述走,先读综述再看列表更顺。

  2. 2按设计原则分组

    数据、预训练、下游适配分开列。

  3. 3看训练规模

    这类模型的结论极度依赖训练细胞数。

  4. 4顺链接读原文

    清单只给题目与出处。

如何确认成功

能说清单细胞基础模型的三条主要技术路线,并指出各自在数据规模上的差异

注意事项

  • 它是阅读清单,不含实现代码。
  • 这个方向的榜单更迭快,看时间戳。
  • 不同论文的评测协议差异大,分数不能直接比。
  • 综述本身比清单更有阅读价值。

核心亮点

  • 分类清晰,按模型类型和研究方向组织,便于检索
  • 收录全面,涵盖scGPT、Geneformer等主流模型及最新论文
  • 每条论文附代码链接,方便复现和二次开发

不足之处

  • 文档/社区待观察
  • 仅提供论文列表,无模型性能对比或评测数据

适用场景

  • 科研人员调研单细胞基础模型技术路线
  • 生物信息学开发者寻找可用的预训练模型
  • 学生快速入门单细胞AI交叉领域

替代项目

awesome-single-cell、single-cell-papers、awesome-bio-foundation-models

上一篇:fanoutqa

下一篇:data-prep-kit

同类项目推荐

SDV 开源

把真实表格数据变成安全逼真的假数据,随便用不泄露隐私

Synthetic data generation for tabular data

★ 3604 2026-08-10
medalign 开源

用医生真实指令数据,提升大模型在电子病历上的表现

MedAlign is a clinician-generated dataset for instruction following with electronic ···

★ 104 2026-08-09
colour 开源

搞定色彩转换与科学计算,让颜色处理更专业

Colour Science for Python

★ 2686 2026-08-10
speech_dataset 开源

一站式获取中文语音识别训练数据,快速启动ASR实验

The dataset of Speech Recognition

★ 470 2026-08-09
aisheets 开源

像用表格一样批量调 AI,不写代码就能造和改数据集

Build, enrich, and transform datasets using AI models with no code

★ 1653 2026-09-20
tech.ml.dataset 开源

用 Clojure 快速处理大数据集,像 pandas 一样高效

A Clojure high performance data processing system

★ 763 2026-08-22
nepali-datasets 开源

尼泊尔语AI数据一页找齐,省去全网翻找

A comprehensive, curated collection of Nepali datasets aggregated from community sou···

★ 109 2026-09-21