datasets

一键获取细胞高内涵成像数据,直接开跑形态学分析

这是 JUMP Cell Painting Consortium 公开的数据集仓库,主要存放细胞成像实验产生的图像及相关元数据,供生命科学研究者和机器学习从业者下载使用。Cell Painting 是一种通过多种荧光染料同时标记细胞不同结构、再用高内涵显微成像获取形态学表型的技术,广泛用于药物发现和功能基因组学研究。该仓库解决的是这类大规模图像数据分散、格式不统一、难以直接用于建模的问题,提供集中托管和说明文档。核心能力包括:按批次和实验条件组织图像文件、附带样本与处理信息、便于通过脚本批量拉取。由于以 Shell 脚本为主,仓库本身不提供分析工具,更多是数据分发入口。适合需要真实细胞图像做表型分析、图像分类或自监督预训练的研究团队。

开源 free 数据集
访问官网 ↗ GitHub ↗ 文档 ↗
GitHub 星标 ★ 189
维护状态 活跃
是否开源
定价模式 free

项目数据

分类数据集
开发团队jump-cellpainting
所属国家
官网地址
定价模式free
价格说明开源免费数据集
访问状态
是否开源
开源协议BSD-3-Clause
主要语言Shell
技术栈/模型
GitHub 星标★ 189
30天Star增速
HF 下载量
上线时间2022-10-16 00:00:00
最近更新2026-08-28 00:00:00
维护状态活跃
中文支持
访问方式
移动端支持
综合评分
收录时间2026-09-21
浏览次数0

使用教程

核心亮点

  • 提供真实实验来源的细胞成像图像,可直接用于形态学表型研究
  • 由 JUMP 联盟维护,数据来源和实验条件有说明,可信度较高
  • 仓库结构便于按批次定位文件,配合脚本可批量下载

不足之处

  • 仓库以数据托管为主,缺少配套的数据加载和预处理代码
  • 数据体量大,下载和存储对本地环境要求较高

适用场景

  • 训练细胞图像分类或分割模型
  • 做药物处理后的细胞表型差异分析
  • 自监督预训练图像编码器

替代项目

Broad Bioimage Benchmark Collection、IDR (Image Data Resource)、CellProfiler

项目介绍

datasets 是数据集领域的开源项目,由 jump-cellpainting 开发,2022 年首次发布。

它收录于数据集分类,该分类目前共有 278 个项目,GitHub 星标数为 189。

项目目前处于活跃维护状态,最近一次代码更新于 2026-08-28。开源免费数据集。

它主要面向的使用场景是:训练细胞图像分类或分割模型。同类可对比的替代方案包括 Broad Bioimage Benchmark Collection、IDR (Image Data Resource)、CellProfiler。

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