LucaProt

融合序列与结构,精准预测蛋白质功能

LucaProt 是一个基于深度学习的蛋白质功能预测框架,创新性地融合了蛋白质氨基酸序列与三维结构信息。它解决了传统方法仅依赖序列或单一结构特征导致预测精度有限的问题,通过多模态学习捕捉蛋白质的序列-结构协同模式。核心能力包括端到端的特征提取与分类、对未知功能蛋白的自动化注释,以及支持大规模蛋白质组学数据的快速推断。该框架采用Python实现,便于集成到生物信息学工作流中,适用于功能基因组学、药物靶点发现和酶工程等领域。

开源 free 开源模型
访问官网 ↗ GitHub ↗ 文档 ↗
GitHub 星标 ★ 234
维护状态 低维护
是否开源 是
定价模式 free

项目数据

分类开源模型
开发团队alibaba
所属国家
定价模式free
价格说明开源框架,Apache-2.0 许可证,可自由使用和部署,无付费版本。
访问状态
是否开源是
开源协议Apache-2.0
主要语言Python
技术栈/模型deep-learning,dual-channels,large-language-models,lucaprot,protein-language-models,rdrp,rna-virus,transformer,virus,virus-identification
GitHub 星标★ 234
30天Star增速
HF 下载量
上线时间2023-04-12 00:00:00
最近更新2026-09-22 00:00:00
维护状态低维护
中文支持
访问方式
移动端支持
综合评分
收录时间2026-08-09
浏览次数2

使用教程

核心亮点

  • 首次将序列与结构特征联合建模,提升预测准确性
  • 端到端框架,无需人工特征工程,使用便捷
  • 基于Python,易于扩展和集成到现有生物信息流程

不足之处

  • 项目处于早期阶段,文档和社区支持待观察
  • 依赖结构数据,对无结构信息的蛋白质预测受限

适用场景

  • 未知蛋白质的功能注释
  • 药物靶点发现与验证
  • 蛋白质工程中的功能筛选

替代项目

DeepFRI、ProteInfer、DeepGOPlus

项目介绍

LucaProt 是行业应用领域的开源项目,由 alibaba 开发,2023 年首次发布。

它收录于行业应用分类,该分类目前共有 545 个项目,GitHub 星标数为 234。

项目已超过三个月没有代码更新,维护节奏明显放缓,最近一次代码更新于 2026-09-22。Apache-2.0 许可证,可自由使用和部署,无付费版本。

它主要面向的使用场景是:未知蛋白质的功能注释。同类可对比的替代方案包括 DeepFRI、ProteInfer、DeepGOPlus。

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